2016-12-10 65 views
9

3D yoluna dönüştürmek Nasıl X, Y ve Z koordinatlarının üç 1D dizileri verildi, nasıl numpy kullanarak bir 3D örgü yoluna dönüştürmek için?Nasıl x, y, z koordinatları dizileri

import numpy 

def path_2d_numpy(x, y): 
    m1, m2 = numpy.meshgrid(x, y) 
    m1[1::2] = m1[1::2,::-1] 
    r = numpy.append(m1, m2) 
    r.shape = 2,-1 
    return r.T 

from matplotlib import lines 
from matplotlib import pyplot 

def plot_path_2d(path): 
    x, y = path.T 
    pyplot.plot(x, y, '-ro', lw=3) 
    pyplot.show() 

x = numpy.linspace(4, 1, 4) 
y = numpy.linspace(1, 5, 5) 
path = path_2d_numpy(x, y) 
plot_path_2d(path) 

çıkış verdiğinde:

I (döngüler için herhangi yani) numpy kullanarak 2D için bunu başardı

2D mesh path

... ama 3D için bunu yapamadı . (Yani Numpy olmaksızın) saf piton çözümü Gösterilen: çıkışı

import numpy 

def path_3d(x, y, z): 
    nb_points =len(x)*len(y)*len(z) 
    path = numpy.empty((nb_points, 3)) 

    xord, yord, i = True, True, 0 
    for zi in z: 
     for yi in y[::1 if yord else -1]: 
      for xi in x[::1 if xord else -1]: 
       path[i] = xi, yi, zi 
       i += 1 
      xord = not xord 
     yord = not yord 
    return path 

from matplotlib import pyplot 
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D 

def plot_path_3d(path): 
    fig = pyplot.figure() 
    ax = fig.gca(projection='3d') 
    xx, yy, zz = path.T 
    ax.plot(xx, yy, zz, '-bo', lw=3) 
    pyplot.show() 

x = numpy.linspace(4, 1, 4) 
y = numpy.linspace(1, 5, 5) 
z = numpy.linspace(-3, 0, 3) 

path = path_3d(x, y, z) 
plot_path_3d(path) 

:

3D mesh path

Essencialy, ne arıyorum ben için yaptığı gibi path_3d bir numpy uygulanması içindir path_2d_numpy.

Buna ihtiyacım var çünkü uğraştığım diziler oldukça büyük. Numpy olmadan yapmak çok yavaş.

cevap

6

Bu nasıl görünüyor?

import numpy as np 

def path_3d_numpy(x, y, z): 
    coords = np.stack(np.meshgrid(x, y, z), axis=-1) # shape = (nx, ny, nz, 3) 
    coords[1::2,:,:] = coords[1::2,::-1,:] 
    coords[:,1::2,:] = coords[:,1::2,::-1] 
    return coords.reshape(-1, 3) # flatten out the other axes 

senin gibi oldukça aynı sırada noktalarını yineleme yapmaz, ancak Benzer şekilde, 2d vaka

olarak yazılmış olabilir


çevresindeki bazı indeksleri değiştirerek o basitçe düzeltmek olabilir bazı gerçek overkill için

def path_2d_numpy(x, y): 
    coords = np.stack(np.meshgrid(x, y), axis=-1) 
    coords[1::2] = coords[1::2,::-1] 
    return coords.reshape(-1, 2) 

, sen N boyutlarına bu uzatabilirsiniz:

def path_nd(*args): 
    coords = np.stack(np.meshgrid(*args), axis=-1) 
    N = len(args) 

    axes = np.arange(N) 
    for i in range(N-1): 
     # the last axis isn't part of our mesh, so don't roll it 
     rolled_axes = tuple(np.roll(axes, -i)) + (N,) 
     rolled_view = np.transpose(coords, rolled_axes) 
     rolled_view[1::2,:] = rolled_view[1::2,::-1] 

    return coords.reshape(-1, N)