Over-watershedding image

Question

Hücreleri mikroskop görüntülerinde ayırmakta sorun yaşıyorum. Bir su havzası dönüşümünü uygularken, hücreleri bir çok parçaya ayırmak ve onları sınır/asgari düzeyde ayırmak gibi bir sonuca varmam.

http://physics.georgetown.edu/matlab/code.html adresinden bpass filtresini kullanıyorum.

bp = bpass(image,1,15); 
op = imopen(bp,strel('ball',10,700)); 
bw = im2bw(bp-op,graythresh(bp-op)); 
bw = bwmorph(bw,'majority',10); 
bw = imclearborder(bw); 
D = bwdist(~bw); 
D = -D; 
D(~bw) = -Inf; 
L = watershed(D); 
mask = im2bw(L,1/255); 

Herhangi bir fikir çok takdir edilecektir! Hücrelerimin son maskede çok fazla bölünmüş olduğunu görebilirsiniz.

Havza yapmaya çalıştığım görüntü türüdür. Bu 16 bitlik bir görüntüdür, bu yüzden hepsi siyah görünür.

Starting fluorescent image

Final görüntü maskesi:

elle burada hücreleri ayrılmış:

Answer 1

nispeten düz ileri olmalıdır hücrelerin merkezlerini bulma : Şiddetin yerel bir maksimumu bulmak. Bu noktaları havza için tohum olarak kullanarak, this tutorial yararlı bulabilirsiniz. Eğer yarayabilecek

Bazı morphologcal işlemler şunlardır:
- imimposemin - havza dönüşümü hesaplarken bir tohum noktasını zorlayan bir yerel dk olmak.
- imregionalmax - yoğunluk görüntüsünün yerel maksimum değerini bulma.