Maui - işlerin aynı düğümde çalışmasını engelliyor

Question

Kümeye göndermek istediğim bir dizi iş var. Her düğüm, aynı düğümde bir diğeriyle çalışırken önemli ölçüde yavaşlar, ancak düğümde farklı türlerde hesaplamalar yapan başkaları tarafından önemli ölçüde etkilenmez.

Bir Moab (Maui) zamanlayıcısı ile qsub için böyle bir kısıtlama belirtmek mümkün mü?

düğümleri:, Düğüm1, Düğüm2 node3 (20 çekirdekli her)

benim işler:

net olmak gerekirse, burada bir açıklama var MY1, my2, My3, MY4 (her biri 10 çekirdek talebinde)

başka işler: sıranın bütün iş gönderdikten sonra (aşağıdaki atama istiyorum

other1, other2 (her talep 10 çekirdek))

Koşu: Held

node1 <-- my1, other1 
node2 <-- my2, other2 
node3 <- my3 

: gönderirken bunu yapabilirsiniz

my4 

Answer 1

bir yolu istemeyi sonra tek tek her düğüme kilitli genel kaynağının yapılandırılması ve gereğidir Daha yoğun kaynak gerektiren bir iş.

Örnek yapılandırma:

 

    NODECFG[node1] GRES=highdemand 
    NODECFG[node2] GRES=highdemand 
    NODECFG[node3] GRES=highdemand 

Meslek gönderme:

$ qsub -l gres=highdemand -N my1 my.sh 

hala kalan kaynaklar üzerinde çalıştırmak için başka işler izin verirken, her seferinde bir "highdemand" iş düğümleri sınırlayacaktır.