R, knitr ve kaynak işlevi: html raporu için kaynak dosyası yorumları nasıl korunur

Question

R konsolu:source("file_of_functions.R",echo=TRUE) numaralı telefonu aradığımda, yorumlar da dahil olmak üzere tüm kaynak dosya ifadeleri konsolda yazdırılır.

Örme HTML: Bir yığın içinde source("file_of_functions.R",echo=TRUE) koymak ve açıklamalar dışında, aynı çıkış baskılar html örme.

Kodumun ve raporun açıklığı için, kaynak dosyanın yorumlarının html raporuna dahil edilmesini istiyorum.

Herhangi bir öneriniz var mı?

Temel örnek: kaydet fP olarak aşağıdaki:

konsolunda

# function to add a number to itself 
f <- function(x) x+x 
f(2) 

, çağrı source("f.R",echo=TRUE) baskılar: çağrıyı

#function to add a number to itself 
> f <- function(x) x+x 
> f(2) 
> [1] 4 

html örgü

```{r} 
source("f.R",echo=TRUE) 
``` 

, aynı çıktıyı yorum yapmadan verir.

Answer 1

bir cevap olarak yayınla istemem

--- 
output: html_document 
--- 

```{r} 
options(prompt = '> ') 
``` 

```{r} 
source('./test.r', echo = TRUE) 
``` 

```{r} 
source('./test.r', echo = TRUE, keep.source = TRUE) 
``` 

Answer 2

test.Rmd, ama sadece kolayca bir kod yığın haline test.r ekleyebilirsiniz olasılığını işaret etmek istiyorum

```{r code=readLines('test.r')} 
``` 

kullanarak Şahsen ben bu örneğin source() kullanarak çok daha güzel olduğunu düşünüyorum varsayılan olarak > istemlerini almazsınız (isterseniz bunu yapabilirsiniz) ve R kodu vurgulanacak sözdizimi olacaktır. Tabii ki yorumlarınız korunacaktır.